好氧堆肥是在有氧的前提下，借好氧微生物(首要是好氧茵)的感化来遏制的。

在堆肥进程中，糊口废料中的消融性无机物资透过微生物的细胞壁和细胞膜而为微生物所接收，固体的和胶体的无机物吸附着在微生物体外，微生物所排泄的胞外酶分化为消融性物资低温阶段。 当堆肥温度升到45度以上时，发酵进入低温阶段。在这阶段，嗜温性微生物遭到按捺乃至灭亡，嗜热性细小物逐步取代了嗜温性微生物的勾当，堆肥中残留的和新构成的可溶性无机物资。无机物持续分化转化，庞杂的无机化合物如半纤维素、纤维素和卵白质等起头被激烈分化。凡是，在50度摆布遏制勾当的首要是嗜热性真菌和放线菌。温度回升到60度时，真菌几近完整遏制勾当，唯一嗜热性放线菌与细菌在勾当；温度到达70以以上时，对大大都嗜热性微生物己不适合，微生物大批灭亡或进入休眠状况。

腐熟阶段在内源呼吸期间，只剩下局部较难分化及难分化的无机物和新构成的腐殖质，此时微生物活性降落，发烧量削减、温度降落。在此阶段嗜温微生物又占上风，对剩余较难分化的无机物作进一步分化，腐殖质不时增加且不变化，此时堆肥即进入腐熟阶段。降温后，需氧量大大削减。含水量也下降，堆肥物空地增大，氧分散才能加强，此时只须天然透风。